.хак//Корни

После закрытия чрезвычайно популярной виртуальной реальности MMORPG "Мир", в сеть выходит новая версия игры — "Мир R:2". В свой первый день в игре новичок Хасео надеется найти друзей для совместных приключений. Однако его надежды разбиваются, когда его персонажа убивают ради забавы. Спасает его загадочный игрок с одной рукой по имени Ован, который предлагает показать ему мир игры.

Вместе с Ованом и его подругой-клериком Шино, Хасео наслаждается первым годом в игре. Но эта идиллия рушится, когда Шино убивает известный всем игрок Три-Эдж, жертвы которого впадают в кому в реальном мире. В ярости Хасео клянется найти и уничтожить Три-Эджа. .hack//Roots рассказывает о дружбе, которую Хасео завязал в игре до того, как Три-Эдж разрушил их отношения.